En stor del af skolens traditioner er knyttet til kirkeåret. Gudstjenesterne for hele skolen foregår som regel i Blågårdskirken, der har bedst plads. Sognepræsterne fra Blågårdskirken (protestantisk) og Sakramentskirken (katolsk) er sammen om disse fælleskirkelige gudstjenester. På Sankt Ansgars Skole lægger vi vægt på fællesskabet mellem de kristne trossamfund og fællesskabet mellem de troende.
Høstgudstjenesten finder sted i september/oktober, hvor 3. klasserne bærer høstgaverne op til alteret, og hvor vi i fællesskab takker for årets høst. Høstgudstjenesten er første gang eleverne selv skal planlægge en gudstjeneste. Planlægningen giver ofte mange spændende diskussioner og mange fortolkninger af budskabet.
Selv om Lucia-traditionen ikke officielt er en kirkelig helgenfest, så er det en utrolig hyggelig tradition. Eleverne i 6. klasse bærer lys ind i den mørke kirke på Luciadag den 13. december. Siden går de i Luciaoptog rundt på skolen, hvor de syngende med lys i hænderne deler pebernødder ud til deres kammerater. Om eftermiddagen tager eleverne ud på Strandvejen, hvor de går i Luciaoptog for Skt. Joseph søstrene i klosteret. Det er altid en stor oplevelse at besøge et af de få rigtige klostre i København. Fra søstrenes side er det en gensidig oplevelse. En del af søstrene har tidligere været tilknyttet skolen og besøget af de syngende elever vækker gode minder frem. Samtidig bliver elever som lærere bevidste om den tradition, de er bærere af.
Julegudstjenesten er afslutningen på første skolehalvår. Her er det 4. klasserne, der står for årets krybbespil. Krybespillet er altid meget velbesøgt. Tidligere elever, lærere og skoleledere kommer ofte forbi, for det er ikke rigtigt jul før elever fra Sankt Ansgars Skole har fortolket fortællinger om Jesu Kristi fødsel.
På den sidste skoledag før påskeferien fejres påskegudstjeneste, hvor 5. klasserne står for opførelsen af årets passionsspil. Fortællingen om Jesu Kristi død og opstandelse er dramaturgisk en ordentlig mundfuld. Her er de helt store følelser i spil og ofte åbner planlægningen af passionsspillet muligheden for at diskutere nogle af de problemstillinger, der ikke altid er plads til i hverdagen.